Kaikki tietoturvayhtiöt ovat samaa mieltä siitä että Applen laitteet ovat paljon Android-laitteita turvallisempia. Monien eri raporttien mukaan noin 97% haittaohjelmista on kohdistettu Android puhelimia kohtaan.
Androidin sovelluskauppoihin voi livahtaa erilaisia haittaohjelmia sekä viruksia, kun taas Applen sovelluskaupasta App Storesta ei välttämättä löydy niin paljon erilaisia sovelluksia mutta, Apple valikoi todella tarkasti minkälaiset sovelluskehittäjät voivat julkaista omia teoksiaan ja ketkä pääsevät ns. Apple-ekosysteemiin, toisin sanoen, kehittäjien, sovellusten ja laitteiden verkostoon. Kiteytettynä, haittaohjelmia on lähes mahdotonta ladata App Storeen. Tämä tekee iPhonesta paljon turvallisemman kun verrataan Android-pohjan puhelimiin.
Google Play on Googlen omistama sovelluskauppa joka pyörii mainosrahoitteiden kautta jotta se pysyy ilmaisena. Siellä voi kuka vain julkaista itse tehtyjä sovelluksia. Android myös sallii käyttäjien asentaa sovelluksia Google Playn ulkopuolelta, tämä tarkoittaa käytännössä sitä että kaikenlaisia haittaohjelmia/viruksia sisältäviä sovelluksia ei pystytä mitenkään valvomaan.
Myös Androidin päivittämättömät käyttöjärjestelmät voivat aiheuttaa tietoturvaongelmia. Monet eri puhelinvalmistajat käyttävät Android pohjaa puhelimissaan mutta kaikki valmistajat eivät saa päivityksiä samaan aikaan jolloin osa puhelinmerkeistä altistuu isoille tietoturvamurroille. Vain Apple valmistaa iOS pohjan laitteita joka tarkoittaa että samaa ongelmaa ei ole.